Here is the spreadsheet on primer bias. I looked the restriction enzymes up in a catalog.

AFLP Primer                               A+T G+C
EcoR1/Mse1 G A A T T C C     T T A A A C 9 4
EcoR1AG/Mse1G G A A T T C A G   T T A A G   9 4
                                   
Pst1C/Mse1AC C T G C A G C     T T A A A C 7 6
Pst1C/Mse1TG C T G C A G C     T T A A T G 7 6
                                   
                                32 20
Selective Bases in Bold                                  
                                GC/AT = 0.63
                                   
RAPD Primers                               A+T G+C
OPA-01 C A G G C C C T T C           3 7
OPA-11 C A A T C G C C G T           4 6
OPA-13 C A G C A C C C A C           3 7
OPA-14 T C T G T G C T G G           4 6
OPA-15 T T C C G A A C C C           4 6
OPA-16 A G C C A G C G A A           4 6
OPA-17 G A C C G C T T G T           4 6
OPA-18 A G G T G A C C G T           4 6
OPA-19 C A A A C G T C G G           4 6
OPA-20 G T T G C G A T C C           4 6
                                   
                                38 62
                                   
                                GC/AT = 1.63

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Last Updated May 12, 1999